Le secrétariat national a fait partie de la structure nationale du parti unitaire, au même titre que la présidence et le comité. Il se compose d’un secrétaire national, d’un secrétaire général flamand, d’un secrétaire général francophone, et de deux secrétaires adjointes aux secrétaires généraux.
Existant dès la naissance du Parti Social Chrétien, la suppression du secrétariat national n’est pas clairement arrêtée dans les sources.